“豪力！使用空手刀！”“隆隆岩，避开，接着使用破坏死光！”隆隆岩敏捷得避开豪力的空手刀，接着发射出一发黄色的光线，豪力被黄色的光线打中，倒在地上，无法战斗了。现在，阿羽重返神奇宝贝学校七天了，他正在实战课上，和一个四年级学生藤平战斗。
“藤平，你的豪力攻击很强，但是速度这方面有点欠缺，如果你在隆隆岩打出破坏死光的时候避开，就可以在隆隆岩破坏死光副作用下攻击到隆隆岩。你要多练习豪力的速度。”阿羽说道。“谢谢阿羽老师！”
“好，这节课快结束了，还有哪位学生要挑战我？”阿羽对下面一堆四年级学生说道。“我！”一个黑发男生说道，“我是四（2）班的焰闪。”“好！战斗开始！”阿羽说道。这是藤平在后面悄悄对阿羽说：“老师，他是我们年级的级长。”
原来如此，他是级长啊！阿羽想，“我也好怀念我当级长的日子啊！”“阿羽老师！我的神奇宝贝是，镰刀盔。”“那么出来吧，三合一磁怪！”阿羽说道，“三合一磁怪，电磁波！”“镰刀盔，避开，接着使用街头试刀……啊？”
突然，焰闪的表情变得很害怕。“怎么了？”阿羽问他。“老师，那里……”不远处的教学楼上空出现一架黑色的小型直升飞机，飞机上有一个红色的“R”，往神奇宝贝学校扔下一颗空降炸弹。“砰！”教学楼瞬间黑烟四起，接着，阿羽看见教学楼被炸得一片狼藉，很多地方都被炸弹炸坏了。
“呵呵呵，尊敬的优藤校长。”飞机停在校长室门口，走出一个黑衣男，他是火箭队的老大，坂木。“听说你在这里藏着五个神奇宝贝球。”坂木把校长绑了起来，“百分百的收服神奇宝贝的神奇宝贝球。”他脸上露出邪恶的笑容。
“你要干什么？”校长大叫。“交出来。”坂木笑道，“把那些球，交出来！”“我，无论如何都不会交出来的！”“那么……炸！”坂木拿出一个对讲机。“遵命！”第二架直升飞机驶来，里面坐着高级干部，zero和幽丸。幽丸点了一下红色的按钮，又是一颗炸弹从天而降。第二幢教学楼也被炸毁了！
“你还不交出来？”坂木拿出一把M4步枪，对准校长的脑袋。“呵，我现在不会伤害你的，不过，你的资产，将要没了！”接着，出现了由黑轮和雪棠驾驶的第三架飞机，在天上转了个圈，接着向天气训练场炸下子弹，第四架飞机和第五架飞机同时出现，驾驶员是哈迪斯和克里斯蒂娜，以及冥斗和闪彩。
两枚炸弹从寝室和最后一幢教学楼上空降下，这两处也被炸毁了，现在只剩下阿羽所在的自由训练场，以及校长室和仓库没有被炸。“哼，我竟然没有准备第六架飞机，就留你一点小小的资产，可你再不交出来的话……”坂木把手扣在扳机上。“我……我交！就在这里旁边的仓库，放在五层密码门里面，每一层密码都是“ABCDEFG！”
“贵族学校的学生们！快点逃出来，我们已经报警了。”而学校这边的人已经逃出来了，副校长举着大喇叭大喊，“请各班报人数，检查有没有人失踪！”每一个人都逃出来了。阿羽跑得快，自由训练场就在寝室旁边，阿羽趁机跑到寝室拿上了行李，不过大多数学生都是空手。神奇宝贝还好，因为全校都在上自由实战课，所以神奇宝贝都带在手上。
“啊？”站在五年级队列中的圣代脸上一惊，“我的大师球还在寝室！”那是一个珍贵的大师球，是当初表白的那天，和阿羽爱情的信物——表白那天是休业式，阿羽和圣代获二年级全年级第一名的分数，得到了一人一个大师球做奖励，只要这个大师球还在，他们的爱情也还在。如今，圣代的大师球不在了，他们的爱情也要不在的！
其实，他们的爱情在三年级休业式分别的那天就已经不在了，阿羽出发旅行，遇见了小丽，这时，阿羽的大师球就一直放在背包的最下面没动过，可阿羽没有告诉圣代这件事，圣代还以为，阿羽还喜欢着她。现在阿羽的背包还背在阿羽身上，而小丽的大师球，却压在了被炸毁的寝室里。
她跑进了被炸毁的寝室，因为，她爱情中最珍贵的东西，被压在了被炸毁的寝室里。“铁甲暴龙，对着那里使用地震。”坂木拿到了五个大师球后，用地震的方式把仓库也弄毁了。神奇宝贝贵族学校成为了一座废墟。仓库就在圣代的寝室前面，仓库有四层楼，铺天盖地得朝着圣代的寝室倒来……
“圣代！”阿羽急了，虽然阿羽已经不爱她了，可她是阿羽三年的同学，“怪力，使用碎岩术！”阿羽拿出一颗神奇宝贝球，怪力朝着圣代寝室那边使用碎岩术，过了片刻，由于怪力的速度，圣代被找到了！
“找到她了！”阿羽往寝室的废墟跑去，后面跟来了三个老师。圣代躺在那里，手上拿着一个紫色的神奇宝贝球。“圣代！”阿羽靠近她，圣代睁开眼睛，“阿羽，只要这个大师球还在，我们的爱情，也依旧还在……”
阿羽抱起圣代，“圣代，你……”“不行，要送她到医院去！”桑野老师说道。“她还有呼吸。”清岛老师说道。这时，一辆警车开过来。“飞机呢？”池冈老师望望上空。“不见了，飞机不见了。”阿羽说道。“总之，学生们联系家长，今晚我们警方会为你们提供住宿。”君莎小姐说道。
飞远的飞机……
“老大，怎么只有五颗大师球？”zero看见五颗大师球说道。“是五颗，那里有别的大师球，你们难道不知道神奇宝贝学校的镇管之宝就是五颗大师球吗？”坂木老大反问道。“怎么会这样？为什么我检测到了多余的两个大师球？”zero端着电脑说道。
那两颗大师球，是阿羽和圣代爱情的信物。